中國香港文章 表觀遺傳組測序平臺

cfDNA（CellfreeDNA）是人體組織排放到血液、尿液或腦脊液等循環(huán)體系中的降解的DNA小片段，是一種新型的分子標(biāo)記物。ctDNA（CirculatingtumorDNA）特指來源于tumsor細(xì)胞的cfDNA，是液體活檢主流方向。報道表明：ctDNA羥甲基化不但可以作為tumsor分子標(biāo)志物，還可用于追溯tumsor細(xì)胞的組織來源。在醫(yī)療大趨勢下，ctDNA羥甲基化檢測既具有極高的科研價值，又具備推進(jìn)醫(yī)療臨床實踐的巨大潛能，為實現(xiàn)tumsor臨床醫(yī)治的全病程管理提供強有力的支持。利用ctDNA羥甲基化測序，憑一管液體就可以進(jìn)行tumsor診斷、療效評估、實時監(jiān)控、個體化用藥、預(yù)測復(fù)發(fā)等，是里程碑式的新型液體活檢技術(shù)。ai癥組中ctDNA甲基化水平與正常組差異明顯。中國香港文章 表觀遺傳組測序平臺

案例1：孕婦血漿中胎兒環(huán)狀DNA的特征是：呈甲基化狀態(tài)以及被clear原文：CharacteristicsofFetalExtrachromosomalCircularDNAinMaternalPlasma:MethylationStatusandClearance期刊：ClinicalChemistry影響因子：8.322近期，NIPT之父盧煜明教授團(tuán)隊開發(fā)了一種環(huán)狀DNA甲基化分析的測序方案，通過對不同產(chǎn)后時間點的胎兒環(huán)狀DNA含量的評估，研究了胎兒環(huán)狀DNA的體外clear效率。作者還發(fā)現(xiàn)血漿中的胎兒環(huán)狀DNA與母體環(huán)狀DNA相比甲基化程度相對較低。此外，和胎兒線性DNA類似，胎兒環(huán)狀DNA在分娩后從母血中迅速clear?？傊?，該團(tuán)隊基于轉(zhuǎn)座酶和m5C位點酶學(xué)轉(zhuǎn)化方法開發(fā)出了環(huán)狀DNA甲基化測序技術(shù)，并揭示了孕婦血漿中的胎兒環(huán)狀DNA甲基化狀況，為環(huán)狀DNA的深入研究及新型分子標(biāo)志物的開發(fā)提供了新的技術(shù)手段。寧夏修飾表觀遺傳組測序結(jié)果且能單堿基分辨甲基化修飾位點，滿足客戶的各類深入數(shù)據(jù)分析需求。

云序優(yōu)勢一站式服務(wù)：客戶只需提供細(xì)胞或組織，云序生物為您完成從樣品準(zhǔn)備、文庫制備、上機測序到數(shù)據(jù)分析的整套服務(wù)流程。嚴(yán)格的質(zhì)控：嚴(yán)格的質(zhì)控是ChIP-Seq實驗成功的前提。云序生物對ChIP-Seq實驗的各個環(huán)節(jié)進(jìn)行嚴(yán)格的質(zhì)控，盡可能地降低實驗風(fēng)險。優(yōu)化的ChIP流程：ChIP富集效率是ChIP-Seq成敗的關(guān)鍵，云序生物采用商業(yè)化ChIP試劑盒和優(yōu)化的實驗流程，確?？蛻臬@得更好的數(shù)據(jù)。專業(yè)的生物信息學(xué)分析：云序生物具有強大的生物信息學(xué)團(tuán)隊，能夠滿足客戶的各類深入數(shù)據(jù)分析需求。

CUT&Tag 是蛋白質(zhì)-DNA互作關(guān)系研究的新方法，相較于傳統(tǒng)的 ChIP-Seq 具有以下優(yōu)點：省時高效、所需的細(xì)胞量少、背景信號低、可重復(fù)性好等優(yōu)點，甚至可用于單細(xì)胞水平測序。CUT&Tag 有望將蛋白與染色質(zhì) DNA 互相作用的研究變成了一種類似 PCR 反應(yīng)的常規(guī)操作，對基因調(diào)控、表觀遺傳等領(lǐng)域的研究具有**性的意義。 在生物學(xué)研究中，DNA 與蛋白質(zhì)之間的相互作用（DNA-Protein Interaction, DPI）是至關(guān)重要的，基因的表達(dá)、調(diào)控、復(fù)制、重組和修復(fù)，RNA的轉(zhuǎn)運、翻譯和調(diào)控，都離不開 DPI，幾乎所有的生命活動都會涉及 DPI。甚至?xí)鹘y(tǒng)遺傳學(xué)和基因組學(xué)帶來**性影響。

在過去十年中，對非小細(xì)胞肺ai（NSCLC）的理解發(fā)生了重要的變化。現(xiàn)在證實，NSCLC具有不同的分子亞型?，F(xiàn)在醫(yī)生認(rèn)為，針對NSCLC的個性化醫(yī)治，應(yīng)該是利用這些分子亞型匹配相對應(yīng)的靶向療法。表皮生長因子（EGFR）突變和ALK易位被認(rèn)為是NSCLC醫(yī)治很有效的靶點。但是EGFR和ALK的突變數(shù)量是多種多樣的，并且我們檢測到的突變類型還在不斷地增加。因此，現(xiàn)代科學(xué)家們利用基于NGS的ctDNA技術(shù)，從患者血液中可以獲得ROS1，BRAF，KRAS，HER2-，c-MET，RET，PIK3CA，F(xiàn)GFR1和DDR2的突變信息，從而利用這些突變信息為患者選擇合適的靶向療法。在治 療過程中，ctDNA甲基化水平與ai細(xì)胞數(shù)量呈正比。云南服務(wù)表觀遺傳組測序價格

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早在十九世紀(jì)后期，科學(xué)家就通過顯微鏡觀察到了蛋白質(zhì)與 DNA 直接的相互作用，從那以后，他們開始深入探索蛋白質(zhì)結(jié)合并控制 DNA 的作用機制。為了研究 DPI，科學(xué)家發(fā)明了很多方法：凝膠阻滯、DNaseI 足跡實驗、甲基化干擾、體內(nèi)足跡、酵母單雜、ChIP-Seq 等。其中 ChIP-Seq 因其能真實、完整地反映結(jié)合在 DNA 序列上的靶蛋白，是目前全基因組水平研究 DPI 的標(biāo)準(zhǔn)實驗技術(shù)。 ChIP-Seq 的基本過程包括甲醛交聯(lián)將細(xì)胞內(nèi)與 DNA 結(jié)合的蛋白固定，再裂解細(xì)胞，超聲斷裂 DNA，將 DNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物結(jié)合在特異性抗體上，再用可以結(jié)合抗體的 ProteinA 磁珠將抗體-蛋白-DNA 復(fù)合物抓取下來，之后將 DNA 與蛋白解離，將 DNA的片段補平，加 A，加接頭，進(jìn)行高通量測序。中國香港文章 表觀遺傳組測序平臺

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